《本草提纲》共52卷，分16部60类，载药种，附方个，附图幅，是李时珍历三十年的扛鼎之做。书中对古代本草中已阐发的体例，逐一鉴识，反覆验证，并根据本人的阅历和肉膂力行地搜罗第一手材料，凸起医药贯串及运用，将植物、动物、矿物、冶金、地质、化学、物候、天文、地舆、农桑等学科常识融入此中，被达尔文誉为“华夏古代的百科全书”。

此书成稿后，李时珍过程量种道路试验出书，均因经费或墟市因为遭拒，直至年再次拜见王世贞请序，王世贞称此书“博而不繁，详而有要，综覈到底，直窥渊海，实性理之精微，格物之通典”，评估极高，金陵书商胡承龙遂决计发行，用时四年，世称“金陵版”。“金陵版”问世后，社会反应激烈，昆裔最具代表性的三个翻刻本系统是万历三十一年江西巡抚夏天良刻本（“江西本”）、崇祯十三年杭州钱蔚起刻本（“杭州本”）、光绪十一年合肥张绍棠刻本（“合肥本”），翻刻诸本虽在刻印原料方面胜过了“金陵本”，但在体例方面浮现了很多脱漏和错改。如卷四“内伤诸疮”有“皲裂”一项，“金陵本”将“皲裂”二字做小题目，而“江西本”则将此二字混入其上“冻疮”项末一味药“豚脑并涂抹”文内，致使辞意大变，治皲裂的药成了治冻疮的药。这种差错一贯为后来的翻刻本沿袭，而金陵原刻本的价格也因此凸显。

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《本草提纲》改善了华夏保守的分类办法，格式较量统一，叙说也较量科学和精湛，譬喻：把广义的“虫”药扩展到种，此中虫豸药为73种，分为“卵生”、“化生”和“湿生”三类。对动物和植物的分类学的进展具备很粗心义。

《本草提纲》把动物药类按虫、鳞、介、禽、兽、人的顺序分类叙说，反响了做家“从贱至贵”，从初级到高档的生物退化观。

《本草提纲》校正了古人的很多差错之处，如南星与虎掌，原本是统一种药物，往时却误觉得两种药物；昔时葳蕤、女萎觉得是同药，李氏过程鉴识则确觉得两种；苏颂在《图经本草》将天花、括楼分为两处，本来是统一栽植物；古人误认“马精入地变成锁阳”、“草子也许变鱼”，逐一给予校正之。而且在本书中还参加了很多新的药物。对某些药物的疗效，李时珍还过程本人的阅历做了进一步的刻画。本书还载叙了大批珍贵的医学材料，撤除大批附方、验方及治验病案外，尚有一些实用的医学史料。

本书不只是一部药物学著做，仍是一部具备宇宙性影响的博物学著做，书中波及的体例极其宽泛，在生物、化学、天文、地舆、地质、采矿致使于史籍方面都有确定的进贡。

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